有人將PCS分為2類，第1類為現有診斷水平能明確原因的膽胰疾病;第2類為目前尚不能明確原因的“真正”PCS。將膽囊切除術後綜合徵的病因為：
1.術前症狀繼續存在
(1)診斷錯誤或不全面：膽囊異常的標準不正確、吞氣症、易激惹結腸、食管裂孔疝、十二指腸潰瘍、冠狀動脈疾病、肋間神經炎。
(2)複發性膽石。
(3)肝內結石。
(4)鄰近器官的病變：胰腺炎、Oddi括約肌狹窄、狹窄性膽總管炎或膽管炎、 肝病(肝硬化)、腫瘤被忽視。
2.膽囊切除術本身引起的症狀
(1)手術操作失敗：遺留了肝內或肝外膽管結石、腫瘤被忽視。
(2)手術操作失誤：損傷膽管。即刻：出血、膽汁性腹膜炎、膿腫、瘻管;遲發：狹窄、膽囊管殘餘。
(3)術後粘連。
(4)生理紊亂：摘除了有功能的膽囊、Oddi括約肌運動障礙。
3.其他 精神性因素等。
