干擾素 干擾素具有抗病毒和免疫調節作用，可使一定比例的患者持續抑制病毒複製甚至病毒清除（HBsAg陰性），可顯著降低HBV相關肝硬化患者的肝細胞癌發病率。和一項研究表明，在相同的干擾素治療1年後，肝硬化患者的HBeAg清除率明顯高於非肝硬化患者，分別為59%對24 肝硬化患者的HBeAg清除率明顯高於非肝硬化患者，分別為59%對24%。因此，有學者認為，如果沒有禁忌症，排除急性肝炎發作，IFNα可作為代償良好的肝硬化HBV DNA陽性患者的一線抗病毒藥物。劑量和療程：普通干擾素，每隔一天皮下注射500WIU；聚乙二醇干擾素（α-2a），每週一次皮下注射180μg。療程為1年。在用藥過程中，應密切監測病情，如果有明顯的干擾素應用禁忌症，應及早停藥。
核苷類似物 該類藥物具有較強的抑制HBV作用，可明顯改善肝功能和肝組織炎症、壞死和纖維化病變。目前有拉米夫定、阿德福韋酯、恩替卡韋酯和替比夫定。目前的試驗表明，代償期肝硬化患者連續口服拉米夫定可降低肝功能失調和原發性肝細胞癌（HCC）的風險，但這種藥物的耐藥率相對較高，而阿德福韋酯和恩替卡韋的耐藥率較低，因此更適合長期口服。
