尖銳溼疣的治療必須採用綜合治療。
1.治療誘因(包皮過長、陰道炎、包皮龜頭炎、淋病等)。
2.提高機體免疫力。
3.化學治療
(1)0.5%鬼臼毒素酊(或0.15%霜) 適用於治療直徑≤10mm的生殖器疣，臨床治癒率可達90%左右。用藥疣體總面積不應超過10cm2，日用藥總量不應超過0.5ml。用藥後應待局部藥物自然乾燥。副作用以局部刺激作用為主，可有瘙癢、灼痛、紅腫、糜爛及壞死。另外，此藥有致畸作用，孕婦忌用。
(2)5%咪喹莫特霜 治療尖銳溼疣，疣體的清除率平均為56%。該療法的優點為複發率低，約為13%。出現紅斑不是停藥指徵，出現糜爛或破損需要停藥並複診，由醫生處理創面及決定是否繼續用藥，副作用以局部刺激作用為主，可有瘙癢、灼痛、紅斑、糜爛。妊娠期咪喹莫特的安全性尚未確立，孕婦忌用。
(3)80%～90% 三氯醋酸或二氯醋酸 需由醫生實施治療。使用時，在疣損害上塗少量藥液，待其乾燥，此時見表面形成一層白霜。在治療時應注意保護周圍的正常皮膚和黏膜，如果外用藥液量過剩，可敷上滑石粉,或碳酸氫鈉(蘇打粉)或液體皂以中和過量的、未反應的酸。此藥不能用於角化過度或較大的、多發性以及面積較大的疣體。不良反應為局部刺激、紅腫、糜爛等。
