應用抗病毒藥物。一般只要堅持規則的綜合治療都可治癒。
1. 手術療法
對於單發、面積小的溼疣，可手術切除;對巨大尖銳溼疣，可用Mohs氏手術切除，手術時用冷凍切片檢查損害是否切除乾淨。
2. 冷凍療法
利用-196℃低溫的液體氮，採用壓凍法治療尖銳溼疣，促進疣組織壞死脫落，本法適用於數量少，面積小的溼疣，可行1-2次治療，間隔時間為一週。
3. 激光治療
通常用CO2激光，採用燒灼法治療尖銳溼疣，本療法最適用女陰、肛周的溼疣。對單發或少量多發溼疣可行一次性治療，對多發或面積大的溼疣可行2-3次治療，間隔時間一般為一週。
4. 電灼治療
採用高頻電針或電刀切除溼疣。方法：局部麻醉，然後電灼，本療法適應數量少，面積小的溼疣。
5. 微波治療
採用微波手術治療機，利多卡因局麻，將桿狀輻射探頭尖端插入尖銳溼直達疣體基底，當看到就體變小、顏色變暗、由軟變硬時，則熱輻射凝固完成，即可抽出探頭。凝固的病灶可以用鑷子挾除。為防止復發，可對殘存的基底部重複凝固一次。
6. β-射線治療
我們應用β-射線治療尖銳溼疣取得了較為滿意的效果，該方法療效高，無痛苦、無損傷、副作用少，複發率低，在臨床上有推廣價值。
7. 藥物療法
(1)足葉草脂：本療法適用溼潤區域的溼疣，但對宮頸尖銳溼疣不能用足葉草脂治療。用20%足葉草脂酊劑塗到皮損處或用藥前，先有油質抗菌藥膏保護皮損周圍的正常皮膚或粘膜 ，然後塗藥，用後4-6小時，用30%硼酸水或肥皂水清洗，必要時3天后重複用藥，該藥是國外用於本病治療的首先藥，一般用一次可愈。但有很多缺點，如對組織破壞性大，使用不當可引起局部潰瘍。毒性大，主要表現為噁心、腸梗阻、白細胞及血小板減少，心動過速、尿閉或少尿，故使用時必須謹慎，發現上述反應時，應立即停藥。
(2)抗病毒藥：可用5%酞丁胺霜劑，或用0.25%皰疹淨軟膏，每日2次，外塗。無環鳥苷口服，每日5次，每次 200mg，或用其軟膏外用，α-干擾素每日注射300萬單位,每週用藥五天。或干擾素300萬單位注入疣體基部，每週2次。連用2-3周，主要副作用為流感樣綜合症，局部用藥副作用較少且輕微。
(3)腐蝕劑或消毒劑：常用有30%-50%三氯醋酸或飽和二氯醋酸，或18%過氧乙酸。用 10%水楊酸冰醋酸或40%甲醛、2%液化酚、75%乙醇蒸餾水100ml混合溶液，點塗局部，用於龜頭、肛周溼疣，每日或隔日一次，效果甚好。消毒劑可用20%碘酊外塗，或2.5-5%碘酊注射於疣體基部，每次0.1-1.5ml，或用新潔爾滅外塗或以0.1-0.2%外敷，後者需配合全身療法。
