1、外部環境因素(感染宮內或圍生期損傷等):作用於具有自閉症遺傳易感性的個體所導致的神經系統發育障礙性疾病。
2、心理因素:自閉症兒童認知能力的損害，使其在思維或思考他人的想法時有障礙或大腦的“執行功能”有缺陷總之，在心理因素方面，可能是多個因素的共同作用引起自閉症的種種臨床症狀。
3、大腦半球優勢障礙：對高功能自閉症成人狀的神經心理測試中發現許多功能障礙，諸如技能運動、複雜的記憶和語言等，但記憶、簡單的記憶和語言、視覺空間功能良好，從而證明自閉症有複雜信息處理的某些缺陷，多見於左側大腦半球，很少見於右側大腦半球。
4、出生缺陷和神經發育異常：自閉症兒童常有發育延遲，神經系統檢查中發現一些原始反射持久不消失，多種神經系統軟體徵和腦電圖異常，其中3/4患兒智能發育遲緩健康搜索，1/4患兒可發生癲癇，其他如結節性硬化症、苯丙酮尿症、脆性X綜合徵、Rett綜合徵伴發自閉症也較多見。
