兒童腹瀉有多種原因，主要有飲食搭配不當、餵養方法不正確、天氣變化、感染及生理性特點等。
一些6個月以下母乳餵養的孩子，常見大便稀薄，每日4～6次，多則10餘次，甚至大便中含有奶塊和少量透明的黏液，常常在餵奶後即排便。但除了腹瀉外，小兒其他方面正常，如精神愉快、食慾良好、睡眠安穩，大便化驗也正常，這種情況我們稱之為“嬰兒生理性腹瀉”。其原因可能與小兒消化系統發育不夠成熟，消化功能暫時性低下有關。隨著年齡的增長，消化功能漸趨成熟和完善，腹瀉最終不治而愈，一般情況下不必用藥。
家長們對孩子的營養都十分重視，總是希望給孩子更多更好的食物。但是兒童胃酸度低、消化酶含量不足，攝取食物過多會導致消化不良，甚至引起腹瀉。在這種情況下，適當限制飲食量、添加胃蛋白酶等會有助於改善消化，減輕腹瀉，而不必使用止瀉藥、消炎藥等。
如果是細菌感染造成的腹瀉，一般孩子的表現比較重，可以出現嘔吐、腹瀉、腹痛、發燒等，嚴重的可出現脫水、休克等，大便中可以看到黏液、血性分泌物等，這時需要及時對症處理。因為腹瀉僅僅是一種症狀，人體通過排便可以把腸內的微生物和毒素排出體外，從而有利於病菌的消除，這時的腹瀉是一種保護性機制，如果立即用止瀉藥，反而會使腸蠕動減少，細菌和毒素就不容易排出體外，反而容易引起中毒。因此對於細菌性感染造成的腹瀉，治療主要是選用消炎藥，補充足夠的水分和電解質。有些家長在孩子發生腹瀉時，以為不給孩子吃東西就可以減輕腹瀉，甚至連水分也不給補充，這是十分危險的。家中如果沒有甚麼藥物，可以用糖鹽水喂孩子，以減輕脫水對循環的危害。
