中醫學認為，本病主要是由先天稟賦不足，後天失養，導致人體正氣不足，衛氣不固，或熱病後期，氣陰兩傷，邪毒乘虛侵入，邪毒與氣血相搏，虛火上炎而致。因此中醫在治療念珠菌病的過程中一般都是採用辨證施治的方法進行。
念珠菌病的中醫辨證療法
(1)胎熱上攻型：
臨床表現：口腔白色斑點，如乳渣積滯，尤其以兩頰、舌面上附著白色厚膜，剝離後見底，煩躁，拒奶，吮乳啼哭，小便短赤，大便秘結，舌質紅，苔膩，脈滑而數，指紋紫滯。
治法：清熱瀉脾。
方藥：瀉黃散加減。藿香，梔子，生石膏(先煎)，防風，知母，柴胡，甘草。
加減變化：口燥咽乾，啼哭不止者，加銀花、玄參、桔梗。小便短赤者，加生地、竹葉、木通。
(2)氣陰兩虛型：
臨床表現：口腔白屑散在，周圍紅暈不明顯，顏面色紅，五心煩熱，形體虛弱，精神倦怠，舌體瘦小而紅，少苔，脈細數無力。
治法：益氣健脾，滋陰降火。
方藥：知柏地黃湯加減。知母，黃柏，熟地，黨參，黃芪，山萸肉，山藥，澤瀉，茯苓，丹皮，甘草。
加減變化：虛熱甚者，加地骨皮、銀柴胡。食慾不振，脘腹脹滿者，加木香、砂仁、白朮。心悸怔忡者，加麥。
