導致兒童鼻竇炎的原因可以是病毒或細菌感染，也有一部分與過敏有關。鼻竇炎發生後，原發或繼發感染的細菌多為肺炎鏈球菌、流感嗜血桿菌、金黃色葡萄球菌、厭氧菌等，因此在治療上抗生素是必要的。
但是，如果孩子的鼻涕主要是黏白或清鼻涕，也可不用抗生素。兒童鼻竇炎治療首選的抗生素包括：青黴素類藥物，推薦使用阿莫西林+克拉黴素;頭孢類藥物主要使用一代和二代，三代頭孢主要針對高耐藥的肺炎鏈球菌。
1.鼻噴激素
是治療兒童慢性鼻竇炎的首選消炎藥物，能有效減輕鼻塞症狀，可作為兒童鼻竇炎的一線治療。目前認為鼻用激素對急慢性鼻竇炎有比較好的效果，對慢性鼻竇炎而言，至少連續使用12周以上。這種局部應用激素類藥物，是安全和有效的，對兒童的成長髮育沒有影響。
2.黏液促排劑與鼻用激素和抗生素配合使用，非常有效。可以稀釋鼻涕，促進鼻涕的排出，恢復鼻黏膜的功能。
3.抗過敏藥對伴有過敏因素的孩子，可以口服片劑或滴劑，控制過敏，治療過敏性鼻炎，防止慢性鼻炎的發生。
4、中藥清熱、解毒的中藥可以緩解病情
需要注意的是，治療兒童慢性鼻竇炎不推薦使用喹諾酮類藥物，因其對兒童骨骺發育有抑制作用。另外，不推薦多種抗生素聯合使用。慢性鼻竇炎發病時間較長，患兒規範治療至少應保證3個月以上。
