本病發病年齡自13～91歲，絕大多數超過50歲，病人一般以尿道梗阻，腫物，尿道周圍膿腫，尿外滲，尿道瘻和尿道流出分泌物等症狀而就醫，一些病人有疼痛，血尿或血精症狀，舟狀窩腫瘤可表現為潰瘍或乳頭狀病灶，直腸雙合診檢查可瞭解腫瘤有無擴展至前列腺，肛門和尿生殖膈，前尿道常見症狀是排尿困難，與尿道狹窄相似，部分病例可出現排尿刺激症狀，勃起功能障礙，尿道血性分泌物溢出或合併血尿，尿道癌可發現尿道結節或腫塊，大的球膜部尿道癌在會陰部可觸及腫塊。
根據臨床和病理活檢結果作臨床分期，並根據手術標本病理所見進行復核。
O期：侷限於粘膜(原位癌)，A期：病變至粘膜下層，B層：病變侵入尿道海綿體，C期：直接擴展至尿道海綿體外組織或超過前列腺包膜，D1期：區域性轉移包括腹股溝/盆淋巴結(原發瘤可為任何期)，D2期：遠處轉移(原發瘤可為任何期)。
對陰莖進行系統手法檢查，由尿道外口至會陰球膜部觸摸尿道和陰莖海綿體有無硬結腫塊，檢查雙側腹股溝淋巴結，尿道造影可幫助確定腫瘤的大小，部位，尿道膀胱鏡檢查可瞭解腫瘤的範圍並活檢。
