《黃帝內經》把人體的五臟六腑命名為十二官，其中，心為君主之官。它這樣描述心：“心者，君主之官。神明出焉。故主明則下安，主不明，則一十二官危。”君主，是古代國家元首的稱謂，有統帥、高於一切的意思，是一個國家的最高統治者，是全體國民的主宰者。把心稱為君主，就是肯定了心在五臟六腑中的重要性，心是臟腑中最重要的器官。
“神明”指精神、思維、意識活動及這些活動所反映的聰明智慧，它們都是由心所主持的。心主神明的功能正常，則精神健旺，神志清楚;反之，則神志異常，出現驚悸、健忘、失眠、癲狂等症候，也可引起其他臟腑的功能紊亂。另外，心主神明還說明，心是人的生命活動的主宰，統帥各個臟器，使之相互協調，共同完成各種複雜的生理活動，以維持人的生命活動，如果心發生病變，則其他臟腑的生理活動也會出現紊亂而產生各種疾病。因此，以君主之官比喻心的重要作用與地位是一點兒也不為過的。
在中醫理論中，心為神之居、血之主、脈之宗，在五行屬火，配合其他所有臟腑功能活動，起著主宰生命的作用。心的主要生理功能有兩個：
1.心主血脈
心主血脈包括主血和主脈兩個方面：全身的血，都在脈中運行，依賴於心臟的推動作用而輸送到全身。脈，即血脈，是氣血流行的通道，又稱為“血之府”。心臟是血液循環的動力器官，它推動血液在脈管內按一定方向流動，從而運行周身，維持各臟腑組織器官的正常生理活動。中醫學把心臟的正常搏動、推動血液循環的這一動力和物質，稱之為心氣。另外，心與血脈相連，心臟所主之血，稱之為心血，心血除參與血液循環、營養各臟腑組織器官之外，又為神志活動提供物質能量，同時貫注到心臟本身的脈管，維持心臟的功能活動。因此，心氣旺盛，心血充盈，脈道通利，心主血脈的功能才能正常，血液才能在脈管內正常運行。
2.心主神志
心對於人體，如同君主在國中處於主宰地位;九竅各有不同的功能，正如百官各有自己的職責一樣。如果心能保持正常，九竅等各器官也就能有條不紊地發揮其作用;如果心裡充滿著各種嗜慾雜念，眼睛就看不見顏色，耳朵就聽不見聲音。所以說心要是違背了(清靜寡欲的)基本規律，各個器官也就會失去各自應有的作用。
另外，在生活中，人們常用“心腹之患”形容問題的嚴重性，卻不明白為甚麼古人要將心與腹部聯繫起來。所謂“心”，即指心臟，對應手少陰心經，屬裡;“腹”就是指小腸，為腑，對應手太陽小腸經，屬表。“心腹之患”就是說，互為表裡的小腸經與心經，它們都是一個整體，誰出現了問題都是很嚴重的。
正是因為心臟對人體健康決定性的作用，我們平常要加強對心臟的養護，還要多注意自身的變化，以便儘早發現心臟疾病，中醫認為“心開竅於舌”，“舌為心之苗”，也就是說心與舌的關係密切，心臟的情況可以從舌的色澤及形體表現出來。心的功能正常，舌紅潤柔軟，運動靈活，味覺靈敏，語言流利;心臟氣血不足，則舌質淡白，舌體胖嫩;心有淤血，則舌質暗紫色，重者有淤斑;心火上炙，則舌尖紅或生瘡。所以，心的養生保健方法要以保證心臟主血脈和主神志的功能正常為主要原則。
