本病應注意與良性交界瘤、幼年性黑色素及細胞性藍痣相鑑別，亦更應注意與基底細胞癌相鑑別。還應注意與硬化性血管瘤、老年痣、脂溢性角化病、甲床下陳舊血腫相鑑別。
1、良性交界痣 鏡下所見為良性大痣細胞，並無異性細胞，僅在真皮內生長，其炎性反應不明顯。
2、幼年性黑色素瘤 於小孩面部呈生長緩慢的圓形結節。鏡下見細胞呈多形性，有核分裂。瘤細胞不向表皮浸潤，且瘤體表面亦不形成潰瘍。
3、細胞性藍痣 好發於臀、尾骶、腰部，呈淡藍色結節，表面光滑而不規則。鏡下可見樹枝狀突的深黑色細胞、大稜形細胞，並集合成細胞島。有核分裂相或壞死區時，應考慮到有惡變的可能。
4、基底細胞癌 是上皮細胞的惡性腫瘤。由表皮的基底層向深部浸潤，癌巢周圍為一層柱狀或立方形細胞。癌細胞染色深，無一定排列。癌細胞內可含黑色素。
5、硬化性血管瘤 表皮過度角化，真皮乳狀增殖，擴張的毛細血管常被向下延伸的表皮突圍繞，貌似表皮內血腫一樣。
6、老年痣 見於老年人體表呈疣狀的痣，表皮過度角化，粒層部分增厚或萎縮，棘層肥厚，基層完整，亦可有色素增加。真皮乳頭增殖，外觀呈乳頭瘤樣增生。
7、脂溢性角化病 病灶亦呈乳頭瘤樣增生，表皮下界限清楚，角化不完全，粒層先增厚，後變薄甚或消失，增生的表皮細胞內可有少量或較多的黑色素。
8、甲床下血腫 多有相應外傷史。鏡下為乾枯的血細胞，可有上皮成纖維細胞增生。
