臨床出現不明原因的急性腎功能不全時要考慮急性間質性腎炎可能。具有下列臨床特徵者應考慮慢性間質性腎炎：
① 存在導致慢性間質性腎炎的誘因，如長期服用止痛劑、慢性尿路梗阻等，或有慢性間質性腎炎家族史;
②臨床表現有小管功能障礙，如煩渴、多尿、夜尿增多、腎小管性酸中毒等，或腎功能不全但無高血壓、無高尿酸血癥等;
③尿液檢查表現為嚴重小管功能受損。少量小分子蛋白尿(<2.0 g/24 h)、尿 RBP、溶菌酶、尿β2- 微球蛋白、NAG 升高，可有糖尿、氨基酸尿。
慢性間質性腎炎還須根據病史和臨床病理特徵進一步明確病因。
急性間質性腎炎主要與急性腎小球腎炎、急進性腎小球腎炎、其他原因的急性腎衰竭相鑑別。相應疾病的特殊臨床表現、實驗室檢查、影像學檢查有助於提供診斷線索，但鑑別困難時應及時考慮腎活檢。
慢性間質性腎炎應該考慮與一下疾病鑑別，鑑別困難時可以腎穿刺。
① 高血壓腎損害：臨床表現類似慢性間質性腎炎，但長期高血壓病史，伴有心臟、眼底等靶器官有助於鑑別;
②慢性腎小球腎炎：常有顯著的蛋白尿、血尿、水腫及高血壓，腎小球功能損害先於腎小管。
