1、疾病類型不同：
毛囊炎是細菌性皮膚病，完全是因外界細菌感染皮膚毛囊而產生毛囊疾病;而痤瘡是皮膚附屬器病，是由身體內部病變引發皮膚受損的，內部疾病是“肇事者”，皮膚受損是“受害者”。
2、病因不同：
毛囊炎發病原因簡單，為凝固酶陽性金葡菌感染引起，是皮膚表面的原因，與身體內部是否病變無關;痤瘡發病原因複雜，感染細菌丙酸桿菌只是次要原因，主要原因來自身體內部內分泌系統失衡，與雄性激素、皮脂腺分泌旺盛、毛囊皮脂異常角化及遺傳等因素有關。
3、好發部位不同：
毛囊炎好發於面部、頸部、臀部及四肢等易與衣物發生摩擦的部位;痤瘡好發於面頰、額部，其次是胸部、背部及肩膀部等皮脂分泌旺盛的部位。
