結腸癌手術後是否進行化療主要取決於腫瘤的分期以及手術的徹底性。
腫瘤的分期主要包括腫瘤侵犯的深度，是侷限於腸壁以內，還是已經穿透腸壁的漿膜，前者還是比較早期，後者復發和轉移的機會就比較大，需要追加輔助性的化療；其次為切除腸管系膜內的淋巴結是否有轉移？轉移的數量多少？
按照規定病理科醫生需要檢查12枚以上的淋巴結，如果均沒有轉移那就比較早期，如果已經有1-3枚淋巴結'甚至於超過3枚以上淋巴結轉移了，尤其是已經有遠離腫瘤的遠處淋巴結轉移，那就問題比較大了，最好追加輔助性化療，降低術後復發或轉移的風險。另外這裡還要看系膜內是否有神經和脈管的侵犯，脈管內是否有癌栓，如果有，提示覆發和轉移機會會明顯增大，建議追加化療。最後是否伴有肝肺、腹腔等遠處轉移，如果已經有明確或懷疑的轉移，建議儘早進行化療，控制腫瘤的生長。
另外手術切除的徹底性非常重要，即使腫瘤局部不太早期，但切除的非常徹底，輔助性化療對於進一步提升生存率幫助也不大。但是，如果各種原因腫瘤不能切除的很乾淨、很徹底，可能有腫瘤殘留，那就必須追加化療。
當然，對於輔助性化療，是目的是進一步提高手術的效果，提高生存率，較低複發率和遠處轉移率，僅適用於中晚期的腸癌患者。而且是否做還需要看病人的年齡和全身狀態，如果慢性病很多，全身情況比較差，需要通盤權衡其風險和收益，決定是否做。
