正常的受孕需要男方有足夠數量的活精子進入到女方的陰道，穿過女方的宮頸、子宮腔到達輸卵管；女方能正常排卵，其輸卵管有撿拾卵子的能力並通暢，子宮正常能孕育胎兒。以上任何一個環節出現問題都可能引起不孕症。多項流行病學的調查顯示，在不孕症中，男方因素約佔35％，女方因素約佔45％，不明原因性不孕約佔10％，男女雙方均有問題的佔10％。在女性不孕中，輸卵管性因素約佔40％，排卵因素約佔40％，不明原因約佔10％，另外10％為不常見因素，包括子宮因素、宮頸因素、免疫因素等。
1、卵巢因素：卵巢發育不全、黃體功能不全、卵巢早衰、多囊性卵巢綜合症、卵巢腫瘤等影響卵泡發育或卵子排出的因素都會造成不孕。排卵障礙是造成女性不孕症較常見的原因，沒有成熟卵泡發育及排卵就不可能懷孕。排卵障礙包括完全沒有排卵、很少排卵或是不規則排卵，臨床表現為閉經、月經稀發或是子宮內膜不正常出血。多囊卵巢綜合症就是因為垂體激素異常引起的排卵功能障礙，導致不孕。
2、輸卵管功能障礙：在正常情況下，從卵巢排出的卵子，必須要能被輸卵管的傘部揀拾。當卵子進入輸卵管後，依靠輸卵管內的纖毛運動將卵子向子宮腔方向運送，在輸卵管1/3（壺腹部）的地方卵子與精子會合並受精，在受精之後，受精卵進一步分裂形成早期胚胎，在排卵後的第4-5天（接近囊胚期時），胚胎被運送到子宮腔，在子宮定居下來。
所以輸卵管的功能有三：揀拾卵子，為精卵受精及早期胚胎髮育提供養分，運送卵子、胚胎至子宮腔內。 當輸卵管因細菌感染髮炎、子宮內膜異位症或手術後引起粘連，都會影響輸卵管揀拾卵子及運送卵子的功能。細菌感染也會破壞輸卵管內的纖毛，使胚胎沒有辦法被運送至子宮腔內正常著床，也不能提供適當的養分使早期胚胎髮育。而輸卵管功能障礙導致精子和卵子不能相遇就會發生不孕症。
3、子宮頸和子宮因素：宮頸管先天性異常、閉鎖或狹窄、息肉、糜爛、腫瘤、粘連等均可影響精子通過；宮頸粘液中存在抗精子抗體，不利於精子穿透宮頸管或完全使精子失去活動能力，均可以導致不孕症的發生。
4、免疫學因素：指女性生殖道或血清中存在有抗精子抗體，引起精子互相凝集，喪失活力或死亡，導致不孕或不育。此外，部分不孕婦女的血清中存在有對自身卵子透明帶抗體樣物質，可阻礙精子穿透卵子受精，亦可引起不孕。
5、中樞性的影響：丘腦下部、垂體、卵巢間內分泌平衡失調，垂體腫瘤或瘢痕都可以引起卵巢功能失調而致不孕；精神因素如精神緊張或過度焦慮，可對下丘腦-垂體-卵巢軸產生影響抑制排卵引起不孕。
6、全身性疾患：如重度營養不良，或飲食中缺乏某些重要的營養因素，都可影響卵巢功能而致不孕；慢性疾病、代謝病如甲狀腺功能低下或亢進、糖尿病、腎上腺功能紊亂等也能導致不孕。
7、精液因素：由泌尿系統疾病、性傳播性疾病及腮腺炎等因素引起的精液液化時間延長，少、弱精子症，無精子症，血精症，精子活力低下，高畸形率精子症，死精症，均可降低生育能力，甚至引起不育。
8、生殖功能障礙：男性器質性因素妨礙傳導、不良生活習慣影響及消極心態等因素引起的陽痿、早洩、不射精、逆行射精等，無法將精子輸至女性的宮頸口，導致男性不育。女性的性抑制、性厭惡、性慾高潮障礙、性交疼痛及陰道痙攣等亦可影響精卵相遇，導致不孕。
9、染色體因素：常見的有男性假兩性畸形、克氏綜合徵和XYY綜合徵。染色體異常需要根據具體情況。有的是無法生育的，即使受孕也是反覆胎停育後流產，畸形，死胎，無法保胎成功，目前是無法治療的。
