如果咳嗽幾個星期甚至幾個月沒有好轉的話，就要注意了，問題就不是那麼簡單了。要考慮哪些疾病呢?首先考慮的是有沒有慢性感染，最常見的就是慢性支氣管炎了，也要排除腫瘤和結核的可能性。不過大家不要擔心，對於這些情況，很多醫院尤其是大醫院的呼吸科的醫生一般都會想到的，會通過各種檢查幫您診斷或者排除的。
但是對於一些長期咳嗽，尤其是幾個月甚至幾年的咳嗽，咳嗽的時候，痰又不多，檢查了很多醫院有沒有查到病因的患者，可能要注意一下有沒有風溼免疫性疾病的可能性。這類疾病由於病因一時難以找到，不少患者病情就拖下來了。由於查不到病因，因此很多病人也僅僅是止咳化痰治療，效果很不好。
為甚麼這些病止咳化痰治療效果不好呢?這是因為沒有找對病因，只能“隔靴搔癢”、對症治療。試想，如果是細菌性肺炎，我們該怎麼辦呢?是不是隻是用些止咳、退燒的藥物就會好呢?顯然這樣的治療是不會好的。這是因為，止咳化痰、消炎退熱只能夠一時控制症狀，但是引起肺炎的細菌還在那裡，如果不把這些細菌殺死，肺炎是不會好的，而且任由細菌繁殖的話，還會有生命危險。因此，很多人得了細菌肺炎，到了醫院，醫生是一定會用抗菌素等藥物進行治療，將細菌殺死的，否則病情不會好轉。
對於者風溼免疫性疾病，由於它的病因不是細菌或者病毒這些微生物的感染，而是我們免疫系統的異常活化引起的。所以這類疾病必須要通過控制免疫系統才能夠從根本上治療好咳嗽。其實很多典型的風溼免疫性疾病都可能有咳嗽的症狀。這類疾病名字列起來可能有一大串，例如系統性紅斑狼瘡、類風溼關節炎、強直性脊柱炎、多發性肌炎-皮肌炎、乾燥綜合徵、結節病、組織細胞增多症、肺出血-腎炎綜合徵、特發性肺含鐵血黃素沉著症、韋格納氏肉芽腫、慢性嗜酸粒細胞肺炎等等，當然還有很多其他風溼免疫性疾病也可以引起咳嗽，在這裡就不一一列舉了。
免疫系統的異常活化為何會導致咳嗽呢?這是因為我們的免疫系統是身體的防護系統，主要是打擊侵害我們身體細菌或者病毒等微生物的。我們的肺是用來呼吸新鮮的氧氣，排除我們體內的二氧化碳的，因此是通往外界的重要門戶。但是在我們呼吸的空氣中，經常會有一些細菌和病毒等微生物，這些微生物就通過我們吸入的空氣進入到我們的肺裡了。所以，大家還記得2003年SARS的時候，全國人民都戴口罩的情景吧，就是要防止SARS病毒進入我們的肺裡造成感染。
為了對抗這些細菌或者病毒，我們的身體在肺裡配備了強大的免疫系統，這些免疫系統的細胞可以產生很多東西，來對抗細菌或者病毒。因此，人就不容易嚴重感染了。但是免疫系統經常出錯，在對抗細菌的時候，把自己的肺裡面的細胞或者組織當成細菌或者病毒來打擊。這個時候，免疫系統乾的反而是壞事，即損害肺裡的細胞或者組織。因此，就會造成咳嗽。
這種咳嗽有一個特點，就是老是乾咳、痰也不多、有的時候還有胸悶、憋氣。由於不是細菌或者病毒引起的，因此抗感染的治療肯定是沒有甚麼效果的。
