(1)病原微生物：包括細菌、病毒、螺旋體、立克次體等，是引起咽炎的病因，可直接來源於空氣、飲食，也可間接來源於血液循環和淋巴循環。
(2)物理或化學性刺激：如講話過多，喜食辛辣、燙熱飲食，菸酒過度，化學性氣體、粉塵等空氣汙染，均可損傷咽部粘膜上皮和腺體。破壞局部防禦體系這也是引起咽炎的病因。
(3)氣候、季節因素：寒冷可造成咽部粘膜血管收縮，吞噬細胞數目減少，局部抵抗力下降;乾燥可影響咽部粘液分泌和纖毛蠕動，降低對空氣的清潔、加溼作用，直接對咽部粘膜造成刺激和損害;冬春季節氣候變化大，室內空氣流通差，也容易引起抵抗力下降和致病微生物入侵。
(4)鄰近器官疾病：鼻腔;鼻竇、口腔、牙齒、牙齦、喉、氣管、支氣管等鄰近器官的急、慢性炎症，沿著粘膜、粘膜下組織、局部淋巴和血液循環侵犯到咽部，或炎性分泌物反覆刺激咽部，或鼻病呼吸受阻而被迫張口呼吸等，均可導致咽炎。
(5)全身疾病：過敏體質或患有全身疾病，如風溼熱、痛風、糖尿病，心臟病、貧血、腎炎、氣管炎、肺氣腫、支氣管擴張、結核、肝硬變及消化系統疾病造成的營養不良、便秘等，均可導致全身抵抗力下降、咽部血液循環障礙，進而引發咽炎。
(6)其它過度疲勞，精神緊張，睡眠不足等也是引起咽炎的病因。
