儘管長期以來關於局部應用抗生素這一投藥方法一直存在較多爭議，抗生素局部使用在治療細菌性外耳道炎和中耳炎等疾病中已經運用了多年，並且耳科醫生目前仍然廣泛使用抗生素滴耳液。中耳炎病人普遍使用抗生素滴耳液，中耳手術之後，術腔中也常規填塞抗生素油紗條。
鑑於抗生素濫用的現狀，2004年衛生部、國家中醫藥管理局、總後衛生部公佈了《抗菌藥物臨床應用指導原則》，其中建議：“抗菌藥物的局部應用宜儘量避免：皮膚黏膜局部應用抗菌藥物後，很少被吸收，在感染部位不能達到有效濃度，反易引起過敏反應或導致耐藥菌產生”，不過指導原則中補充說明：“抗菌藥物的局部應用只限於少數情況，例如全身給藥後在感染部位難以達到治療濃度時可加用局部給藥作為輔助治療……某些皮膚表層及口腔、陰道等黏膜表面的感染可採用抗菌藥物局部應用或外用，但應避免將主要供全身應用的品種作局部用藥，局部用藥宜採用刺激性小，不易吸收，不易導致耐藥性和不易致過敏反應的殺菌劑，青黴素類、頭孢菌素類等易產生過敏反應的藥物不可局部應用。氨基糖苷類等耳毒性藥不可局部耳。
對於侷限性的軟組織感染，由於全身應用抗生素有費用高、全身毒不良反應多、且很難達到並維持局部抗炎滅菌所需的高濃度等不足，使人們自然想到了局部應用抗生素。局部應用抗生素不通過打針、吃藥等方式，而是將抗生素直接用於需要部位而起作用。由於局部應用抗生素的方法簡便、安全且行之有效，因而一直被用於治療侷限性軟組織感染。
局部應用抗生素的優點：
①可以準確地在所需部位投藥，並形成幾十甚至幾百倍於全身應用抗生素時的藥物濃度；
②可以在局部迅速達到峰值藥物濃度並長時間維持；
③雖然局部藥物濃度極高，但用藥總量及進入血液循環的藥量少於全身用藥，因而不會對全身重要臟器產生毒不良反應；
④當局部發生軟組織感染時或行手術清創後，由於機體的自然防禦機制，這一區域是缺乏血供的，而局部應用抗生素可以直接作用於病變部位，不需血液將藥物攜帶至這一區域，因此病變局部的缺血不致影響療效。
當然除了過敏和耐藥之外，由於局部藥物濃度過高，對於軟組織特別是神經組織有明顯損害，這也是耳毒性抗生素絕對禁忌直接用於耳部抗感染的原因。
