1.遺傳因素
通過對家族史的仔細分析，家族性POF的發病率在不同的人群中報道分別為4%～31%，可見遺傳因素在POF中佔主要地位。X染色體的異常一直被公認為是引起POF的主要病因，隨著分子生物學的進展，研究者們在常染色體上也發現了越來越多的與POF相關的候選基因。
2.免疫因素
自20世紀50年代開始，研究者發現9%～40%的POF患者合併其他內分泌腺體或系統的自身免疫性疾病，如自身免疫性甲狀腺炎、系統性紅斑狼瘡、重症肌無力、甲狀旁腺功能減退、類風溼性關節炎、特發性血小板減少性紫癜、糖尿病等。POF患者常合併2種或以上的自身免疫性疾病，所有伴隨POF的自身免疫疾病中，甲狀腺疾病是最常見原因，12%～33%的POF患者能被檢測出患有甲狀腺疾病。18%的POF患者中，家族中存在遺傳的甲狀腺疾病，第二常見的是多腺體自身免疫疾病(PAGD，Addison病合併內分泌系統功能障礙)，在PGADⅠ型中，POF發病率為 17%～50%，PGADⅡ型中，POF的發生率為3.6%～7%，PGADⅡ型中包括自身免疫性Addison病、甲狀腺自身免疫和胰島素依賴型糖尿病，還有其他如白斑、禿頂、慢性萎縮性胃炎、惡性貧血等，這些綜合徵自然病程變化多端，在發病前後都有可能出現POF的症狀，如Addison病，POF 通常比腎上腺症狀要提早發生。
