本品大苦大寒，過服久服易傷脾胃，脾胃虛寒者忌用。苦燥傷津，陰虛津傷者慎用。胃虛嘔惡，脾虛洩瀉，五更腎瀉，慎服。
1、《本草經集註》：惡菊花、蕪花、玄參、白鮮;畏款冬。
2、《藥性論》：惡白殭蠶，忌豬肉。
3、《蜀本草》：畏牛膝。'
4、《綱目》:黃連大苦大寒，用之降火燥溼，中病即當止，豈可久服，使肅殺之令常行，而伐其生髮沖和之氣乎?
5、《本草正》：黃連善瀉心脾實火，虛熱妄用，必致格陽，故寇宗熒日：虛而冷者，慎勿輕用;王海藏日：夏月久血痢不用黃連，陰在內也。
6、《本草經疏》:凡病人血少氣虛，脾胃薄弱，血不足，以致驚悸不眠，而兼煩熱躁渴，及產後不眠，血虛發熱，洩瀉腹痛，小兒痘瘡，陽虛作洩，行漿後洩瀉，老人睜胃虛寒作瀉，陰虛人天明溏洩，病名腎洩，真陰不足，內熱煩躁諸證，法鹹忌之，犯之使人危殆。
