何時減藥、停藥是患者從治療開始就非常關心的問題，也是臨床醫生非常難回答的問題。現有證據顯示，70％-80％的癲癇患者經藥物治療後發作可以得到控制，其中超過60％的患者在撤除藥物後仍然無發作。在開始減藥後的2年之內，約30％的患者可能再次發作，絕大部分發作出現在開始減藥的最初9個月內。
1、患者在藥物治療的情況下， 2-5年以上完全無發作，可以考慮停藥。
2、患者經較長時間無發作，仍然面臨停藥後再次發作的風險，在決定是否停藥之前應評估再次發作的可能性。腦電圖始終異常、存在多種發作類型、有明顯的神經影像學異常及神經系統功能缺損的患者，複發率明顯升高，應延長服藥時間。
3、不同綜合徵預後不同，直接影響停藥後的長期緩解率。如兒童良性癲癇綜合徵，1-2年無發作就可以考慮停藥;青少年肌陣攣癲癇即使5年無發作，停藥後的複發率也很高;Lennox-Gastaut 綜合徵可能需要更長的治療時間。
4、停藥過程應該緩慢進行，可能持續數月甚至1年以上。苯二氮卓類和苯巴比妥的撤藥除了有再次發作的風險，還可能出現戒斷綜合徵(焦慮、驚恐、不安、出汗等)，所以停藥過程應該更加緩慢。
5、多藥聯合治療的患者，每次只能減掉一種藥物，並且撤掉一種藥物之後，至少間隔1月，如仍無發作，再撤掉第二種藥物。
6、如果在撤藥過程中出現發作，應停止撤藥，並將藥物劑量恢復到發作前的劑量。
