首先通過病史、體格和化驗檢查，根據詳細的資料和化驗結果，綜合分析，判斷引起兒童矮小的原因，最後確定治療原則。原因不同，處理方法也不同：
1、營養不足：應合理營養、全面均衡飲食，培養良好的飲食習慣，促進食慾等。
2、全身疾病引起的矮小：應積極治療原發疾病。
3、家族性矮小和體質性生長髮育遲緩：通過各種調養，充分發揮生長潛力，可酌情使用生長激素。
4、精神因素引起：改善生活環境，使兒童得到精神上的安慰和生活上的照顧
5、先天性遺傳、代謝性疾病：根據情況進行特殊治療。
6、甲低、垂體性侏儒、先天性卵巢發育不全、小於胎齡兒、特發性矮小等應對症治療。
