芜菁二年生草本，高达90厘米。块根肉质呈白色或黄色，球形、扁圆形或有时长椭圆形，须根多生于块根下的直根上。茎直立，上部有分枝，基生叶绿色，羽状深裂，长而狭，长30～50厘米，其中1/3为柔弱的叶柄而具有少数的小裂片或无柄的小叶，顶端的裂片最大而钝，边缘波浪形或浅裂，其他的裂片越下越小，全叶如琴状，上面有少许散生的白色刺毛，下面较密;下部茎生叶象基生叶，基部抱茎或有叶柄;茎上部的叶通常矩圆形或披针形，不分裂，无柄，基部抱茎;侧面生长多个裂状叶片从上向下逐渐变小。
总状花序长，花小，鲜黄色，长约7毫米;萼片4，2列，展开;花瓣4，十字形，具长爪;雄蕊6.4强;雌蕊1，子房上位，1室，由1层膜质隔膜隔成假2室。长角果圆柱形，长3.5～6厘米，喙细长。花期春季。
本植物的花(芜菁花)，种子(芜菁子)亦供药用，各详专条。与萝卜的区别：芜菁与萝卜同属十字花科，并且萝卜部分品种跟芜菁的形状很相似，都是圆球状，所以有些人就会将其混淆。
但是两种植物还是有区别的。芜菁为芸薹属，萝卜则是萝卜属，且小颗芜菁的肉质较为硬，水分较少，芜菁成熟后肉质较为松软，所以可作为主食加以食用。萝卜成熟后脆嫩多汁。不过两者在药用价值跟食用价值上都十分接近。其外形与甘蓝或苤蓝也不相同。
