对于大多数睡眠呼吸障碍，目前没有特效药物可以控制或治愈。对于不能进行有效病因治疗的患者，呼吸机治疗是最佳选择睡眠呼吸障碍疾病的病因比较复杂，而每个人的主要致病因素可能存在差异。针对不同病因和不同的病理损害，需要进行个体化治疗，而个体化治疗方案需由专科医师综合评估患者的情况后制定。清华大学附属清华长庚医院睡眠医学中心掌握了大量针对病因和相关病理损害的检查监测技术，同时，配合内镜和影像学检查等技术，对每位患者的病因和病理生理进行综合分析，针对不同个体的致病因素及病情特点进行个体化治疗。
对于大多数睡眠呼吸障碍，目前没有特效药物可以控制或治愈。主要治疗方法包括外科手术、口腔矫治器、呼吸机治疗、颏舌肌刺激器等。对于存在明显解剖结构狭窄的患者来说，外科手术可以很好地解决问题。外科手术前，需对上气道解剖结构进行仔细的检查评估，不同的阻塞部位，不同的解剖结构，需采取不同的手术方式。但是，部分患者不适用，手术存在一定风险。
对于不能进行有效病因治疗的患者，呼吸机治疗是最佳选择。呼吸机治疗的原理是，在睡眠时通过机器输送一定的正压支撑咽腔，帮助维持气道开放。其优势是无创、应用范围广、治疗效果好，缺点是携带使用较麻烦，很多患者不能耐受。在进行呼吸机治疗前，必须进行规范的压力、模式的调配并选择合适的面罩，否则很难获得满意的疗效。
睡眠呼吸障碍疾病需要多学科协作治疗。清华长庚医院睡眠中心施行多学科专家参与的“团队诊疗”模式，根据每一位患者的疾病特点，会诊评估后制定个体化的治疗方案，为各类睡眠障碍患者提供“一站式”诊疗，解除患者烦恼。
