蓝耳病感染后由于继发感染的影响，会表现许多不同的临床症状。共同症状是发热，体温达40.0~41.5度，体表皮肤发绀、出血，皮肤严重发绀时呈蓝紫色，耳部发绀呈蓝紫色的频度最大，因此，又把猪繁殖与呼吸障碍综合症成为“蓝耳病”。体表皮肤发绀、出血是繁殖与呼吸障碍综合症病程发展的一个重要症状阶段。一般表现五种情况。
毛囊出血
毛囊出血又常见两种情况：一种是出血点密布全身，针尖大，不会扩大，若病情好转，出血点会逐渐消失。另一种是患猪皮肤、特别是颈部和背部皮肤密布铁锈色或蓝紫色出血点。
保育-生长猪 发病常突然出现厌食，体温升高达40.0～41.5度，出现眼眶浮肿，发绀呈蓝紫色，吻突发绀呈蓝紫色，耳发绀呈蓝紫色的三蓝现象。
哺乳仔猪发病往往是经胎盘感染后生下的弱仔。这种弱仔多在产后24小时死亡，不死的3~4天后就出现毛焦、消瘦、鼻唇干燥、呼吸困难、体温升高、发抖、四肢做游泳状姿势、蹄边发绀呈蓝紫色、站立不起、拉稀、无力吸乳，死亡率高。
阴囊出血是公猪最常见的症状。阴囊皮肤刚开始出血时是密密麻麻的淡血点，远看似淡血斑，随之越来越明显，越来越严重，变为蓝紫色，再进一步发展蓝紫色出血灶坏死、干固、硬结，类似蓝紫色球形结痂。
