绿藻门植物的繁殖方式也多样,管状绿藻(Caulerpa prolifera)无性生殖和有性生殖都很普遍,有些种类的生活史有世代交替现象。有通过营养繁殖、无性植物繁殖的;而有性繁殖的方式多种多样。同配、异配和卵配都有存在。绿藻通常会有包含纤维素的细胞壁,进行无中心粒的开放有丝分裂。
有性生殖常见,其配子有2或4条尾鞭型鞭毛。无性生殖有裂殖(原球藻属)、段殖或产生动孢子和不动孢子(丝藻属、鞘藻属)等方式。其中蛋白核绿藻的繁殖方式最为独特。蛋白核绿藻就是一种单细胞的藻类植物,整个遗传的物质全部在细胞核中。单细胞的绿藻含有丰富的叶绿素并且堆积得很密。它是吸收了太阳能量进行光合作用反复进行细胞分裂繁殖的神秘植物,生产人们所需要的各种氨基酸、蛋白质及维生素等;对肽类物质进行正确的加工,从而使这些肽具有正常的生物活性。
绿藻又是一种高能量植物,不用种子来繁殖后代。绿藻的繁殖方式是特有的生物活性生长因子C.G.F(Chlorella Growth Facter)决定的。C.G.F是绿藻独有的活性成分。有了C.G.F这种特殊的促进生长活性成分,使绿藻具有高超的“分身术”。一个绿藻细胞1分为2,然后2个分为4个,4个变8个,越分越多,并保证细胞基因不会发生变异。在生长环境优越的情况下,一个绿藻的细胞内可以分出4~16个孢子来。这些小小的孢子又长成了母亲的模样,于是一个小球藻经过“分身术”变成了4~16个绿藻。