肛痿的原因多为一般性化脓感染，少数为结核性，克罗恩病、溃疡性结肠炎、恶性肿瘤、肛管外伤等也可形成肛瘘。大多数肛痿起自肛管直肠周围脓肿，当脓肿自行破溃或切开引流处成为外口;脓肿缩小，形成感染性管道，其原发病灶成为感染源不断进入管道内口，因此经久不愈。外口皮肤生长较快，常常假性愈合，以致又破溃，反复发作。
肛瘘的分类
1.肛管括约肌间型
瘘管只穿过肛管内括约肌。外口常只有一个，距肛缘较近。
2.经肛管括约肌型
瘘管穿过肛管内括约肌、外括约肌浅都和深部之间，外口常有多个，并有支管互相沟通。
3.肛管括约肌上型
为高位肛瘘，瘘管向上穿过肛提肌，然后向下至坐骨直肠窝，穿透皮肤。因瘘管常累及肛管直肠环，故治疗困难，需分期手术才不致造成肛门失禁。
4.肛管括约肌外型
少见，瘘管穿过肛提肌直接与直肠相通，这类肛瘘常因克罗恩病、肠癌或外伤引起。
