1、甲状腺机能亢进症
临床上将甲状腺机能亢进症误诊为病毒性心肌炎者屡见不鲜。如果刚好发病前有上呼吸道感染史，更难以鉴别。甲亢病人心率较快，自觉心悸、胸闷，但此类病人往往多汗易怒，体重下降，手震颤阳性。临床查甲状腺功能可确诊。按甲亢治疗有效。值得一提的是甲亢病人多伴有心脏改变，临床增加误诊率。
2、β—受体功能亢进综合征
临床将β—受体功能亢进症误诊为病毒性心肌炎者最为常见，尤其在基层医院。本病以年轻女性多见，常因心悸气促、阵发性胸闷、胸痛就诊，心率较常人稍快，追问病史多与情绪刺激有关，与劳力无关。每次发作持续数小时，伴有叹息等症状，查超声心动图无异常发现，应用β—受体阻滞剂效果良好。
3、二尖瓣脱垂综合征
临床上二尖瓣脱垂综合征可出现心悸、胸闷、胸痛，甚至伴有各种心律失常，心电图可出现ST-T异常，因而易误诊为病毒性心肌炎。本病心脏杂音较明显。临床超声心动图以及心肌坏死标志物有助鉴别诊断。
4、不明原因的心律失常
临床上很多心律失常如房性期前收缩，室性期前收缩找不到具体原因，如果刚好上呼吸道感染后出现，容易误诊为病毒性心肌炎。对此类病人要进一步观察，检查心电图和心肌损害标志物，不要随意下病毒性心肌炎诊断。
