1.卵巢。直接作用，雌激素可刺激卵泡发育；间接作用，雌激素血药浓度的高低可促进或抑制促性腺激素的释放，从而间接影响卵巢功能，输卵管雌激素可加快卵子在输卵管内的速度。
2.子宫。雌激素对促进子宫内膜和子宫平滑肌的新陈代谢有重要作用，生精卵泡中适量的雌激素是生精植入的必要条件。阴道雌激素可促进阴道上皮基底层的细胞增殖、分化和成熟，以及角质化和引起细胞核的致密变化。
3、乳腺。雌激素不仅能刺激人体乳腺管的生长，还能促进乳腺泡的发育和乳汁的分泌，促进乳腺管的增生，使乳头和乳晕着色。
4、骨骼。雌激素有促进骨质增生的作用，但可引起骨垢和骨化的早期封闭，影响骨长的增加。绝经妇女可使用雌激素治疗骨质疏松症。
5.蛋白质代谢。一方面，雌激素可刺激肾上腺皮质激素的分泌，抵消生长激素的作用，表现为促进蛋白质的分解；另一方面，肝脏有合成代谢作用，可刺激各种血浆蛋白的合成。
6.心血管方面。雌激素可降低血管通透性，降低血清胆固醇。
7、雌激素通过对下丘脑的正反馈和负反馈调节，控制垂体促性腺激素的分泌。
