神经外科治疗主要针对脑瘫的症状，如肌肉痉挛（肌张力增高）、迟发性运动障碍、扭转性痉挛、震颤、构音障碍等，分为大脑、小脑、脊髓的中枢手术和脊柱神经、四肢周围神经的外周手术。在中枢手术方法中，立体定向脑细胞核破坏术、脑刺激术和脑移植术因其效果不稳定，费用昂贵，不属于治疗脑瘫的常规手术方法，在临床上没有应用。在外周手术方法中，选择性脊神经后根切断术（SPR手术）和外周神经狭窄术是目前治疗脑瘫的主要手术方法。SPR手术历史悠久，能有效缓解四肢的肌肉痉挛。但这种手术创伤较大，需要切除部分椎体，可能对患儿今后的生长发育产生不良影响（前凸后翘等），术后出现严重并发症，如四肢松弛无力，运动功能不如术前。因此，术前要对患儿的情况进行详细分析，术中尽可能少地切除椎体，术中采用神经和肌肉功能监测分析，严格控制手术适应症，使手术达到良好效果，减少并发症的发生。
周围神经缩窄术治疗脑瘫肢体痉挛，创伤小，术后无并发症。四肢的切口为2-5厘米，术后第二天就可以下床开始活动和康复，基本上不影响孩子和家长的正常学习和生活。该手术的目的是去除有害的肌肉痉挛，同时保留原有的肌肉力量，手术效果极佳。
脑瘫中心是一个集手术、康复和电生理学为一体的脑瘫专业科室。该科室成立于2003年，在过去7年中逐步发展和成熟。目前拥有30张病床，手术总量超过6000例，手术有效率达95%以上。主要采用先进的术中电生理监测技术开展周围神经狭窄手术。有专门的康复训练室，配有新型减重步态训练系统和康复自行车等先进设备，为术后患者开展围手术期康复治疗，有专业的康复医师进行训练指导。
此外，科室新引进芬兰Mega6000表面肌电分析系统，主要采集表面肌电信号并进行同步视频监测，对患者进行术前、术后肌力、肌张力测定、关节活动度测定和步态分析，可定量、客观地评估患者痉挛和运动功能障碍的严重程度，为制定手术和康复治疗方案提供依据，也可量化手术和康复疗效，大大提高了手术的准确性。
