一、病理类型
不同类型的甲状腺癌，其预后差别很大。分化良好的甲状腺癌尤其是乳头状腺癌，治疗合理及时，生存期和正常人相差无几，而高度恶性的未分化癌，预后极差，往往在半年内死亡。
二、病变的发展程度
病变的发展程度如肿瘤是否局限在腺叶内，有无大血管的侵犯，是否有淋巴结转移、远位转移等对预后都有影响。据Blake Cady的分化型甲状腺癌的资料分析中，甲状腺外侵犯后，将意味着很高的复发和死亡率，而隐匿癌患者死亡率极低。一般来说小于50px的肿物，其复发和死亡率较低；多发结节的癌瘤较单发结节癌瘤其复发、死亡率稍高；无转移的乳头状腺癌，可长期带瘤生存，术后寿限几乎可以和正常人相同；有淋巴结转移比同类无淋巴结转移者，生存率可降低7％～19％。
三、年龄、性别对预后的影响
性别以及年龄的不同，其预后也有明显的差别。一般女性较男性预后好；年龄在男性大于40岁，女性大于50岁预后差。
1、AMES多因素系统危险组分类：Blake Cady用多元回归方法分析了影响乳头状腺癌疗效的各种因素，并证明了在预测病死率方面有4个因素是很重要的，即患者的年龄，远位转移、癌灶病变程度和肿物的大小。基于以上因素设计成了AMES分数系统，它可将患者分成各种预后不同的风险组。
（1）低危组：没有远位转移的年轻患者；男性小于40岁，女性小于50岁；所有老年患者有以下条件：腺内型乳头状腺癌或微小血管侵犯的滤泡状腺癌或原发癌直径小于125px无远位转移。
（2）高危组：所有的有远位转移的患者；所有的滤泡状腺癌累及大血管的年轻患者；所有的老年患者并有以下条件：腺外型乳头状腺癌或累及大血管的滤泡状腺癌或原发癌直径为125px或大于125px而不论病变的程度。
2、AGES评判模式：4个因素对预后有显著影响：年龄、肿瘤组织分级、肿瘤侵犯范围和肿瘤大小。
预后评分=年龄×0.05＋肿瘤组织分级＋肿瘤侵犯范围 肿瘤直径×0.2
年龄：40岁以下者年龄项为0；
肿瘤组织分级：高或中度分化癌，为“1”，低度分化癌，为“2”；
肿瘤侵犯范围：肿瘤局限于甲状腺体内为“0”，肿瘤已超出甲状腺为“1”，有远处转移为“3”；
肿瘤大小：肿瘤直径(cm)。
例如：50岁患者中度分化乳头状腺癌直径100px，已有远处转移时的预后评分为50×0.05＋1＋3＋0.8=7.3。
早期彻底的甲状腺癌手术预后较好；术后配合内分泌治疗者预后更好。单纯肿块摘除者，预后最差。而无原则地扩大手术范围，往往增加即期死亡率和病残率。延迟手术时间(从病理检查确诊至手术治疗为止)越长，预后越差。故一旦针吸活检或其他组织学诊断确定后，应尽快手术，以提高生存率。
