病毒分型
已确定埃博拉病毒分4个亚型，即埃博拉-扎伊尔型（EBO-Zaire）、埃博拉-苏丹型（EBO-Sudan）、埃博拉-莱斯顿型（EBO-R） 和埃博拉-科特迪瓦型（EBO-CI）。EBO-Z和EBO-S对人类和非人类灵长类动物的致病性和致死率很高；EBO-R对人类不致病，对非人类灵长类动物具有致死性作用；EBO-CI对人类有明显的致病性，但一般不致死，对黑猩猩的致死率很高。
1、扎伊尔埃博拉病毒
扎伊尔埃博拉病毒有高达90％的致死率，在流行地区死亡率1976年为88％、1977年为100％、1994年为59％、1995年为81％、1996年为73％、2001年至2002年为80％，2003年则是90％，2007年平均为83％。
1976年8月26日首次于扎伊尔北边城镇爆发，首位个案纪录为44岁教师Mabalo Lokela，当时他的高烧被诊断为疑似疟疾感染，并且接受奎宁注射治疗，这位病人每日回医院就诊观察，一周后却恶化为无法控制的呕吐，带血腹泻、头痛、晕眩伴随呼吸困难，并开始自口、鼻、直肠等多处开始出血，于9月18日过世，病程仅约2周。
不久之后，更多病患带着相似的症状就医，包括发烧、头痛、肌肉痛、关节痛、疲倦、恶心、晕眩等。这些常发展成带血腹泻、严重呕吐和多发性出血，初期传染可能肇因于重复使用用过却未消毒之针筒，后续传染主要则是照顾病患时，在没有适当安全措施的情况下受到病毒侵袭或传统埋葬前置作业的清洗过程。
2、苏丹埃博拉病毒
苏丹埃博拉病毒在1976年首次在苏丹棉花厂工人身上被发现。研究人员指出，这名工人应该是在工厂中或附近接触到到带原生物宿主，但在检测过工厂附近的动物及昆虫后仍一无所获，带原宿主至今仍是未知。
第二个病例是一位住在苏丹的夜店负责人，当地医院用尽所有的方法治疗他都没有效果，最后还是宣告治。医护人员在治疗时并没有适当的防护措施，导致病毒传遍医院发生大爆发。
最近的爆发发生于2004年5月。2004年5月，苏丹Yambio县回报20个病例，并有五人死亡。疾病管制局在几天后确认这些病例为苏丹埃博拉，邻近国家例如乌干达、刚果皆增加边界的守卫，以控制疫情。1976年苏丹埃博拉的平均死亡率为53％，1979年为68％，2000年至2001年间为53％，平均死亡率为53.76％。
3、雷斯顿埃博拉病毒
1989年11月首次在一群由菲律宾进口至美国维珍尼亚州雷斯顿的食蟹猴身上发现。此一病毒对猴子有很高的致死率，但对人类并没有致命性。
1990年2月，雷斯顿埃博拉病毒再次在雷斯顿、德州及菲律宾爆发。1992年及1996年，更多病例在意大利托斯卡纳和德州发现。所有感染的猴只出现与猿猴出血热类似的症状。在这两次爆发中，没有任何人类受到感染。
4、科特迪瓦埃博拉病毒
科特迪瓦埃博拉病毒这个品种首先在科特迪瓦的塔伊国家公园中被发现。在1994年11月1日，二只黑猩猩尸体在森林里被发现。检验人员发现在心脏中的血液是棕色的且已液化（通常尸体中的血液在死亡十几小时之后就应该完全凝固），内脏外观并没有明显痕迹，肺中充满血液。从黑猩猩身上采取到的组织显示，此病毒与苏丹埃博拉及1976年爆发的扎伊尔埃博拉十分相似。
1994年后，更多死亡的黑猩猩被发现，科学家用许多方法对病毒进行检测。感染的来源被认为是一只被黑猩猩捕食且带有病毒的疣猴。
执行尸体检验的其中一位科学家感染了病毒。她出现了类似登革热的症状并在一星期后被送到瑞士治疗。两个星期后出院，在感染病毒之后的第六个星期完全康复。
