在临床工作中，经常发现许多患者随着治疗时间的延长，病情稳定后思想放松，不按时吃药、不按时随访，依从性由良好变差，CD4+T从稳定或正常到降低，甚至出现了与艾滋病有关的机会性感染等，致使治疗失败，而经检测均存在耐药现象，应引起足够重视。
高效抗逆转录病毒治疗(HAART)是目前控制艾滋病感染的病程、降低患者病死率、延长生存期、降低其传染性的有效办法。目前我国用来治疗艾滋病的药物主要有3类：核苷类逆转录酶抑制剂、非核苷类逆转录酶抑制剂及蛋白酶抑制剂，药物种类少，可供选择的药物有限。融合酶、整合酶抑制剂尚未应用于临床，临床上通常采用联合用药的方法，包括两种核苷类逆转录酶抑制剂和一种非核苷类逆转录酶抑制剂或者一种蛋白酶抑制剂，如果产生耐药，疗效就会明显下降，导致临床上抗病毒治疗失败。
艾滋病抗病毒治疗存在一定的耐药性。如果出现耐药，一般发生在治疗的2-3年后，依从性差是造成耐药的主要原因。许多专家建议：更换药物治疗组合时多考虑选用含有增强作用的蛋白酶抑制剂，从而达到更好的病毒抑制效果。这是因为目前耐药基因突变主要是针对核苷类逆转录酶抑制剂和/或非核苷类逆转录酶抑制剂，而对蛋白酶抑制剂的耐药在临床上目前尚比较少见。
有专家提醒，对从未使用过抗病毒药物的患者也已存在着交叉耐药现象，应引起临床医生的高度重视，需要加强耐药监测，及时调整用药，规范治疗和管理，节省有限的药物资源，以防止耐药的传播。
国内外大量研究证明，艾滋病耐药变异株的出现是艾滋病患者临床上抗病毒治疗失败的主要原因，建议更换药物治疗组合时多考虑选用含有增强作用的蛋白酶抑制剂。
