百日咳的症状初与感冒相似，患儿主要表现为咳嗽、流涕，有时伴有低热。3～4天后，一般症状好转，干咳加重，尤其夜里咳嗽频繁。1～2周后咳嗽为痉挛性、阵发性发作，患者连续咳嗽不止，头部浅静脉充血，面红耳赤。剧咳之后出现特殊的高调鸡鸣吼声，大量的黏液或脓痰由气管排出，有时会伴有呕吐。
早期及时的给予恰当的治疗和护理，可缩短百日咳的病程，减轻并发症。首先，要给予有效的抗菌治疗，一般选用大环内酯类，疗程多数为7～14天。也可选用氨苄西林、复方磺胺甲恶唑等。其次，是对症治疗，痉咳频繁且痰液黏稠不易咳出时，可用祛痰剂或雾化吸入;夜间咳嗽剧烈而影响睡眠者，可给镇静剂。上述药物均应在医生指导下使用。
百日咳的并发症极为严重，多需要及早防治。百日咳最常见的并发症是肺炎，患儿表现为发热、喘憋、鼻翼煽动、面色发青等;最严重的并发症为颅内出血及百日咳脑病。如患儿出现剧烈头痛、烦躁不安，小婴儿出现尖叫哭闹，或抽风昏迷，可能合并颅内出血;如患儿出现神志不清、失语、肢体瘫痪等症状，可能合并脑病，要及时送往医院治疗。
百日咳患儿的日常护理尤为重要。要保证室内空气新鲜，阳光充足，不要在室内吸烟。白天多安排室内或户外活动，保持患儿心情舒畅。避免哭叫、煤烟等不良刺激，减少痉咳的次数。给患儿易消化富有营养的食物，如面条、蒸蛋、米粥等，品种要多样。采用少量多餐的办法，喂食不可过急，食后少动，以免引起呕吐;饮食不可过凉或过热，以免刺激气管而咳嗽。注意孩子的口腔卫生，经常刷牙;年龄小的孩子用淡盐水擦拭口腔，以免发生口腔溃疡。痉咳发作时协助侧卧，坐起或抱起，轻拍背部，助痰排出。咳嗽引起呕吐时，要让孩子把头扭向一边，以免呕吐物进入气管，引起窒息;呕吐完了要给孩子漱口
