HPV感染一般不会影响妇女的生育能力，HPV阳性的妇女可以怀孕。它也不会对胎儿的正常生长和发育产生不利影响。然而，研究证实，在怀孕期间，HPV可以通过母亲和婴儿之间的血液交换通过胎盘传染给胎儿，而且母亲有可能在分娩时通过产道将HPV病毒垂直地传染给婴儿。人乳头瘤病毒大多存在于新生儿的呼吸道中，并可能在婴儿期导致咽部乳头瘤，但这种情况相对罕见。
咽乳头瘤容易复发（有些病人需要多次手术治疗），容易恶变，容易阻塞气道造成不同程度的呼吸窘迫，甚至死亡，预后不良。据报道，有9个孩子是通过阴道分娩出生的，9位母亲在出生时阴道内都有HPV感染。诊断的平均年龄约为4岁。9个孩子被手术切除，其中7个孩子术后复发。
为预防和避免本病的发生，育龄妇女应避免与高危人群的性接触，使用安全套作为屏障保护；孕妇应进行HPV感染筛查；提高自身机体免疫功能，控制病毒感染；由于HPV在母婴间的传播途径，产前可通过胎盘经血液传播，分娩时可通过分娩时吞下的含有HPV的阴道分泌物传播。剖宫产对HPV的宫内传播没有保护作用，但可以减少和避免产科途径的感染。咽乳头瘤病的根本预防在于预防孕妇的HPV感染。
