專家指出：手淫可以對陰莖造成影響，這是一定的，尤其是在發育時期，頻繁的手淫對陰莖，以及整個生殖系統的傷害都非常大，但陰莖短小的最大因素是基因遺傳因素所致，其次是後天的營養不良等因素。下面，就陰莖短小的原因進行介紹：
1、遺傳基因的影響最為根本。
2、在母體懷孕期間因用藥不當影響到雄性激素的分泌，產生先天不足，缺乏健壯性機能的營養和原素，形成先天發育不良。
3、內體寒、怕冷、體內陽氣嚴重不足，致使陰莖不能完全凸出，有部分陰莖仍內縮於腹腔內。
4、青少年發育期間攝入的鋅原素、雄性激素、維生素E和相關蛋白營養不足，缺乏後天能量補充，起不到壯大性器官的作用。
5、性生活過度、身體虛弱或在青少年剛發育期間手淫過頻，使腎臟在發育時無能量去壯大發育性器官，形成陰莖短小;現在青少年是性觀念開放性知識匱乏，家長應該用正確的方法引導孩子瞭解正確的性知識。
6、包皮過長，缺乏生長的必要空間，阻礙陰莖的發育生長。
7、曾患有睪丸炎、隱睪症、睪丸發育不全等症及內分泌不平衡，雄性激素不足。
