一般症狀：典型病例前驅期可有疲勞、全身不適、淡漠、肌痛、頭痛等。90%以上者有驟起的發熱，常達39.5～40℃，半數以上病人持續高熱≥40℃。3/4病人同時伴有寒戰。
呼吸道症狀：患者上呼吸道症狀一般不明顯，有時早期可有輕度乾咳，3～4天后出現少量非膿性痰，痰可為漿液性，亦可以呈明顯血性，稠厚黃膿痰很少見。1/3病人有胸痛，症狀進展很快，可出現進行性呼吸困難。
消化道症狀：軍團菌肺炎病人早期常有無痛性腹瀉，水樣便，無膿血及汙穢氣味。l/4患者有噁心、嘔吐。
神經系統症狀：有精神狀態異常者約佔30%，主要表現為精神錯亂、譫妄、情緒不穩、幻覺、定向力喪失、嗜睡等，其他有共濟失調、構音障礙、震顫與眼球震顫。頭痛是常見症狀，多位於前額部，程度較重，且不常與其他中樞神經系統症狀同在。另外，尚可有定向力障礙、小腦機能障礙等，亦可引起周圍神經、顱神經病變。
