1、新生兒支氣管肺炎如果不及時治療，隨著病情發展患兒可發展為支氣管肺炎，出現高熱、缺氧、呼吸困難、急性呼吸衰竭，甚至出現肺不張、肺氣腫、膿胸、膿氣胸、肺膿腫、心包炎、敗血症等併發症，危及患兒的生命。
2、支氣管擴張
新生兒支氣管肺炎治療不當，病變越來越嚴重，可轉變為慢性支氣管化膿性炎症，破壞支氣管壁使支氣管壁變形擴張，管壁組織被破壞，使支氣管喪失原有的自然防禦能力，也降低了咳嗽效率和排痰功能，為進一步感染提供了條件。時間久了，惡性循環進一步擴大，病情加重，難以治癒。患兒可出現長時間的間斷性發熱，咯大量膿痰或咯血。進一步發展會導致肺源性心臟病。
3、發展為慢性支氣管炎、肺氣腫、肺心病。
4、如果小兒支氣管炎不能徹底治癒，反覆發作，就會轉變成慢性支氣管炎。再進一步就會發展成肺氣腫、肺心病。患兒可反覆發病，長期間斷咳嗽、咯痰、喘息，出現勞力性氣短、心慌、紫紺、水腫，久治不愈。
