預防細菌性腹瀉主要是注意嚴格消毒餵養嬰兒用的奶瓶、奶鍋等物。一般奶瓶和奶嘴用水煮30分鐘即可殺死所有的細菌。牛奶要煮沸飲用。禁止給幼兒吃在冰箱內放置時間較長的食品及飲料和不乾淨的食物。避免長期大量使用廣譜抗生素。
寶寶腹瀉是一種很容易預防的疾病，根據腹瀉發生的原因，應注意以下幾點：
(1)飲食衛生要注意。食品要保持新鮮、清潔，變質的食物千萬不要喂寶寶，食具也必須注意消毒。
(2)母乳餵養最優質。母乳是最符合寶寶的營養需要和消化吸收的，而且母乳中含有大量可以提高寶寶免疫力的成分，寶寶出生後最初的幾個月應該提倡母乳餵養。餵養時要堅持正確的餵養方法，做到按需哺乳，在夏季及寶寶有病時不宜斷母乳。
(3)添加輔食要及時。無論是母乳餵養還是人工餵養，寶寶的生長髮育迅速，爸爸媽媽都應按時給寶寶添加輔食。添加輔食時，要注意寶寶的消化吸收能力，每次只能增加一種，由少到多，一點點地增加，確保寶寶的營養需要。
(4)保證飲食質量。寶寶出生後頭3個月內，如果母乳不足，可適當用牛奶或豆漿補充，但都需要適當稀釋.以便寶寶能充分消化和吸收。母乳不夠或母乳太少採取混合餵養及人工餵養時，應注意飲食調配，過多或過早地餵給寶寶米糊或粥食等食品都是不恰當的，容易發生碳水化臺物消化不良及影響寶寶生長髮育。當寶寶食慾不振時，不要強制寶寶進食。
(5)要增強寶寶體質。天氣溫暖的時候可以多帶寶寶到戶外活動，提高寶寶對自然環境的適應能力，讓寶寶的體質得到增強，機體抵抗力得到提高，遠離各種疾病感染。
(6)不要讓寶寶受到不良刺激。要防止寶寶在日常生活中過度勞累、被驚嚇或精神過於緊張。
(7)注意夏季的衛生及護理。給寶寶添衣減衣要合理，過冷過熱都不行，夜晚睡覺時要注意腹部的保暖。平常要多給寶寶喝水，多進行溫水浴，要飲食有度，不要吃脂肪過多的食物。
(8)體質較弱的寶寶要加強護理。特別是營養不良、佝僂病及病後體弱的寶寶，更應注意飲食衛生，避免各種感染。對剛病發的腹瀉治療要及時，不要延誤形成嚴重的腹瀉。
(9)防止交叉感染。因為感染性腹瀉容易流行，寶寶或家長一旦出現腹瀉必須隔離治療，糞便要消毒處理。
關於細菌性腹瀉的治療，首先要避免濫用抗生素，要在醫生的指導下選擇有針對性的藥物。不要將兩種或三種抗生素一起使用，更不要頻繁地更換用藥。大腸桿菌感染可選用複方新諾明、痢特靈、氨基苄青黴素等;金黃色葡萄球菌感染可以選用青黴素或紅黴素;黴菌感染應選用制黴菌素或克黴唑。
