預防新生兒腹瀉主要是注意嚴格消毒餵養新生兒用的奶瓶、奶鍋等物。一般奶瓶和奶嘴用水煮30分鐘即可殺死所有的細菌。牛奶要煮沸飲用。禁止給新生兒吃在冰箱內放置時間較長的食品及飲料和不乾淨的食物。避免長期大量使用廣譜抗生素。
新生兒腹瀉是一種很容易預防的疾病，根據腹瀉發生的原因，應注意以下幾點：
1、飲食衛生要注意。食品要保持新鮮、清潔，變質的食物千萬不要喂寶寶，食具也必須注意消毒。
2、母乳餵養最優質。母乳是最符合寶寶的營養需要和消化吸收的，而且母乳中含有大量可以提高寶寶免疫力的成分，寶寶出生後最初的幾個月應該提倡母乳餵養。餵養時要堅持正確的餵養方法，做到按需哺乳，在夏季及寶寶有病時不宜斷母乳。
3、添加輔食要及時。無論是母乳餵養還是人工餵養，寶寶的生長髮育迅速，爸爸媽媽都應按時給寶寶添加輔食。添加輔食時，要注意寶寶的消化吸收能力，每次只能增加一種，由少到多，一點點地增加，確保寶寶的營養需要。
4、保證飲食質量。寶寶出生後頭3個月內，如果母乳不足，可適當用牛奶或豆漿補充，但都需要適當稀釋.以便寶寶能充分消化和吸收。母乳不夠或母乳太少採取混合餵養及人工餵養時，應注意飲食調配，過多或過早地餵給寶寶米糊或粥食等食品都是不恰當的，容易發生碳水化臺物消化不良及影響寶寶生長髮育。當寶寶食慾不振時，不要強制寶寶進食。
5、要增強寶寶體質。天氣溫暖的時候可以多帶寶寶到戶外活動，提高寶寶對自然環境的適應能力，讓寶寶的體質得到增強，機體抵抗力得到提高，遠離各種疾病感染。
6、不要讓寶寶受到不良刺激。要防止寶寶在日常生活中過度勞累、被驚嚇或精神過於緊張。
7、注意夏季的衛生及護理。給寶寶添衣減衣要合理，過冷過熱都不行，夜晚睡覺時要注意腹部的保暖。平常要多給寶寶喝水，多進行溫水浴，要飲食有度，不要吃脂肪過多的食物。
8、體質較弱的寶寶要加強護理。特別是營養不良、佝僂病及病後體弱的寶寶，更應注意飲食衛生，避免各種感染。對剛病發的腹瀉治療要及時，不要延誤形成嚴重的腹瀉。
9、防止交叉感染。因為感染性腹瀉容易流行，寶寶或家長一旦出現腹瀉必須隔離治療，糞便要消毒處理。
