1、胃腸道方面：寶寶會拒奶，並有嘔吐、腹瀉、腹痛、腹脹、糞便中帶血等症狀出現，少部份的牛奶過敏也可以引起寶寶便秘。
2、皮膚方面：部分寶寶可能會有兒童特應性皮炎或者溼疹、唇周或眼瞼部水腫的症狀，大部分寶寶會出現蕁麻疹等。
3、呼吸方面：寶寶會出現喘息、頻繁咳嗽流涕、鼻炎等症狀。
另外，嬰兒奶粉過敏可以分為速髮型和遲髮型過敏反應。速髮型過敏是指在進食了含有過敏源的奶粉後2小時內就出現過敏反應，這種反應的症狀一般比較重，嚴重的甚至可危及生命;而遲髮型過敏則是發生在進食了含有過敏源的奶粉後數小時或者數天後，症狀相對較輕。
對奶粉過敏的寶寶，還容易會引起交叉性過敏反應，也就是說，寶寶可能對羊奶、動物皮毛、肉、豆類與蛋類也過敏。
