一治療有特殊病因者應做去因療法，如取出異物，應用抗生素及抗結核治療等。一般用霧化吸入，吸取氣管分泌物，須多變動病兒的體位，或利用拍背方法，使分泌物容易向外排出。對症治療可用支氣管擴張藥、消炎藥以及化痰止喘藥。有呼吸困難時給氧。如不張肺部仍有感染現象，宜採用抗菌藥物，一般先肌注青黴素，無效時可改用其他抗菌藥物。必要時施行支氣管灌洗及吸引分泌物。
二預後毛細支氣管炎、支氣管肺炎、哮喘合併肺不張，主要發生在疾病的極期，待原病治癒後，肺不張即行消失。胰腺囊性纖維性變時因支氣管內充滿黏液樣物質，往往需用黏液溶解劑或支氣管鏡檢查，機械吸痰，管腔始能暢通。吸入異物的患兒年齡愈小，愈易發生肺不張。吸入的花生米或豆類，體積可以膨脹增大，不易取出。X線片上不顯影，極易漏診，日後繼發感染。百日咳、腺病毒肺炎、肺結核等引起的肺不張，可造成永久性纖維化與支氣管擴張。預後決定於引起肺不張的病因、肺不張持續時間、有無合併感染、患兒年齡、阻塞能否及時清除，以及肺大塊萎陷發生肺功能障礙治療無效、吸入異物未經發現而繼發感染、囊樣纖維化、或嚴重先天性心臟病患兒合併肺不張者，預後均不良。
