、呼吸系統：小兒鼻部和鼻咽腔較短，鼻道狹窄，鼻粘膜柔嫩，咽部相對狹小且垂直，喉部相對較長和狹窄。氣管和氣管比成人狹窄，缺乏彈性組織，粘膜纖毛運動差，不能很好地排出微生物。肺臟彈力組織發育差，血管豐富，毛細血管及淋巴組織間隙較寬，間質發育旺盛，肺泡數量較少，肺含氣量相對較少，故易發生感染。另外，小兒呼吸道免疫球蛋白分泌量較低，故免疫功能較差。基於這些特點，所以小兒時期呼吸系統疾病發病率最高，而且小兒呼吸系統儲備能力較低，也較易發生呼吸衰竭。
2、消化系統：新生兒及嬰兒的食管缺乏腺體，彈力纖維和肌層發育不全，胃呈水平位，賁門較寬，且括約肌不夠發達，所以容易發生嘔吐或溢乳。小兒胃粘膜血管豐富，腺體和杯狀細胞較少，分泌的鹽酸和各種酶均比成人少。小兒腸管相對較長，腸壁薄，粘膜富於血管，通透性好，故利於吸收。但腸壁屏障功能差，腸腔內毒素易通過腸壁進入血流，引起中毒症狀。
3、心血管系統：小兒出生時心臟的迷走神經發育尚未完善，交感神經佔優勢，所以心率較快。5歲以後心臟神經結構漸具成人特徵。
4、泌尿系統：小兒腎臟相對較大，下端位置較低，腎孟及輸尿管比較寬，管壁肌肉及彈力纖維發育不完全，容易擴張並易受壓及扭曲而導致梗阻，造成尿瀦留，引起泌尿系感染。女嬰尿道很短，外口暴露且接近肛門，易受細菌汙染。男嬰尿道較長，但常有包莖，積垢時也可引起細菌上行性感染。
5、造血系統：小兒出生後主要是骨髓造血。出生後頭5年，所有骨髓均為紅髓，全部參與造血，以滿足生長髮育需要。以後隨年齡增長，黃髓增多而紅髓相應減少。
