正常女性陰道寄生大量細菌，包括需氧菌、厭氧菌、真菌和衣原體、支原體。細菌可分為致病菌和非致病菌。有些非致病菌在一定條件下可以致病稱為條件致病菌。即使是致病菌也需要達到一定輸倆個或機體免疫力下降時，才會致病。
1、需氧菌
(1)鏈球菌：β-溶血性鏈球菌可分18族B族鏈球菌(GBS)產生外毒素與溶組織酶，使其致病力、毒力播散能力較強，與產褥熱關係密切，可引起嚴重感染其臨床特點為發熱早(平均在產後11小時)，體溫超過38℃，有寒戰心率快、腹脹、子宮復舊不良子宮旁或附件區觸痛，甚至伴發菌血症。需氧性鏈球菌是外源性感染的主要致病菌。
(2)桿菌：大腸桿菌與其相關的革蘭氏陰性桿菌變形桿菌，是外源性感染的主要菌種，也是菌血症和感染性休克最常見的病原菌。大腸桿菌寄生在陰道、會陰、尿道口周圍可於產褥期迅速增殖而發病。大腸桿菌在不同的環境對抗生素的敏感性有很大差異，需行藥物敏感試驗。
(3)葡萄球菌：主要致病菌是金黃色葡萄球菌和表皮葡萄球菌二者的致病有顯著不同。金黃色葡萄菌多為外源性感染，很容易引起嚴重的傷口感染表皮葡萄球菌存在於陰道菌叢內，引起的感染較輕。葡萄球菌因能產生青黴素酶而對青黴素出現耐藥性。
2、厭氧菌
(1)球菌：以消化鏈球菌和消化球菌多見於正常陰道中。當產道損傷時殘留組織壞死，局部氧化還原電勢低該菌迅速繁殖，與大腸桿菌混合感染，放出異常惡臭氣味。
(2)桿菌屬：為一組絕對厭氧的革蘭氏陰性桿菌包括脆弱類桿菌、產色素類桿菌等。此類細菌有加速血液凝固的特點可引起感染鄰近部位的血栓性靜脈炎。
(3)梭狀芽孢桿菌：主要是產氣莢膜桿菌引起的感染，輕者為子宮內膜炎、腹膜炎、敗血症，睜著可引起溶血、黃疸、血紅蛋白尿、急性腎衰竭、循環衰竭、氣性壞疽為死亡。
3、支原體和衣原體
支原體和衣原體均可在女性生殖道內寄生，可引起生殖道的感染。有致病作用的支原體是人型支原體和溶脲支原體。衣原體主要為沙眼衣原體，其感染多無明顯症狀。
