ApoE生理功能有:①是LDL受體的配體,也是肝細胞CM殘粒受體的配體,它與脂蛋白代謝有密切相關性;②ApoE具有多態性,多態性是決定個體血脂水平與動脈粥樣硬化發生發展密切相關;③參與激活水解脂肪的酶類,參與免疫調節及神經組織的再生。
人類ApoE主要在肝臟和腦組織合成,在其他組織包括單核細胞(含巨噬細胞)也有合成能力。人的腎上腺、卵巢顆粒細胞也能合成ApoE。腦中ApoE的mRNA表達總量是肝臟的1/3,星形細胞是其主要合成部位。腦中生成的ApoE的作用可能是使細胞內的脂類重新分配而保持腦環境中的膽固醇平衡。腦腫瘤中發現有高濃度的ApoE,推斷它可能作為神經膠質細胞瘤的標記