為治療黃疸的主要藥物。
1、治溼熱黃疸，用於陽黃(黃色鮮明如橘子色，多見於急性黃疸型傳染性肝炎、膽囊炎等)，取其有促進膽汁分泌和排洩的作用。黃疸初期時，熱重於溼，有發熱、小便不利、大便秘結、腹微脹滿、脈弦數者，則配梔子、大黃以加強清熱瀉火作用，放入茵陳蒿湯。如果溼重於熱，有胸脘滿悶，頭重身困，大便並不秘結，而小便不利的證候較顯著，脈濡緩，則須配五苓散，方如茵陳五苓散。
2、治寒溼黃疸，用於陰黃(黃色暗晦如煙燻，多見於慢性黃疸型傳染性肝炎、肝硬變等病)，有全身虛寒而夾溼的證候，此時須配溫裡祛寒藥如附子、乾薑等，以溫化寒溼，方如茵陳四逆散。
3、作為柴胡的代用品用作清熱。茵陳和柴胡都有解熱作用，中醫經驗認為兩藥都入肝膽，能去肝膽實火。但茵陳的藥性較柴胡稍柔和，故凡平素陰虛而新有實熱，須用柴胡清熱，但又不能受柴胡之剛燥者，可用茵陳代柴胡。
