要檢測病人胃內存在的幽門螺桿菌，一般常採用抽血採樣、胃鏡採樣和呼氣採樣三種檢測方法。
1. 抽血採樣檢測：即採用抽血的方法檢測血清中幽門螺桿菌的抗體水平。因為受到幽門螺桿菌感染後，可在人體內產生相應的抗體，使檢測結果呈現陽性，但是一般需要數月半載才呈陽性，因而幽門螺桿菌感染初期作該項檢測時，檢測結果常常會出現假陰性，從而使患者失去治療的最佳時機。此外，由於幽門螺桿菌即使被根除.但該抗體下降緩慢，患者往往需要1—2年才能轉陰，這樣必然使治癒者長期揹著“陽性”的黑鍋而接受著多餘的治療。
2.胃鏡採樣檢測：可在患者需做胃鏡檢查時“搭車” 採樣，在活檢採樣時一起作顯微鏡檢查.檢測是否有幽門螺桿菌。如果為陽性，即可確診幽門螺桿菌感染陽性。為了給患者制定合適的治療方案，有時還可加做細菌培養和藥物敏感試驗。胃鏡下采樣後還可採用聚合酶鏈反應嚴CR)檢測，這種方法靈敏度較高，結果也比較可靠;也可做快速尿素酶檢測，該方法簡便快速，但由於觀察時間過短或某些因素的影響導致結果不夠可靠。胃鏡採樣還存在下列問題：患者需要經受插鏡之苦，若幽門螺桿菌呈灶性分佈易導致漏診(漏診率達10%左右)。但憑藉醫生豐富的操作經驗和正確採樣，可降低其漏診率。
3.呼氣採樣檢測：該項檢查靈敏度高.檢出率和符合率也很高，患者無痛苦.是近年來最受人們歡迎的一種檢測幽門螺桿菌的方法。具體方法可分為兩種：14C呼氣試驗和13C呼氣試驗。其中14C呼氣試驗費用較低(一般為120元)，但由於該項檢查存在放射線危害，兒童、孕婦、哺乳婦女和年邁體弱者應慎用：對同一患者來說，也宜避免反覆多次採用該種方法檢測。13c呼氣試驗則無放射性，對人體無損害，而且檢出率和符合率更高(接近100%)，各種年齡的患者都可採用該法，其費用一般為200元。檢查前受檢者需空腹三個小時，在採樣過程中，受檢查者在半小時內服一顆膠囊，並先後呼三口氣留取樣本，就能十分準確地檢測出是否存在幽門螺桿菌感染，13C呼氣試驗已被公認為目前檢測幽門螺桿菌的最佳方法。
