可出現腦動脈栓塞，周圍動脈栓塞，肺栓塞，心功能不全，心臟性猝死等併發症。
1.腦動脈栓塞：是房顫的最常見併發症之一，流行病學統計，心房纖顫患者腦卒中的發生率為2%～6%，房顫患者併發全身栓塞中75%為腦動脈栓塞，腦栓塞的栓子主要來自左心房和心耳部，75%的栓子來自左心房內附壁血栓，25%來自動脈粥樣硬化斑塊的脫落。
2.周圍動脈栓塞：周圍動脈栓塞的患者80%有心房顫動，房顫患者的心臟附壁血栓脫落後，隨動脈血流向體循環遠端造成急性動脈栓塞。
3.肺栓塞：房顫患者右心的血栓脫落造成肺動脈及其分支的栓塞發生肺栓塞，肺栓塞的病死率高達20%～40%，美國統計每年有5萬～10萬的肺栓塞患者，佔美國死亡原因的第3位。
4.心功能不全：心房顫動的心室率與患者心功能的狀態密切相關，當房顫並快速心室率時，尤其心臟功能基礎較差時，引起心排血量顯著地急劇降低，導致組織器官灌注不足和急性淤血綜合徵，可併發急性心力衰竭，臨床上以急性左心衰較為常見。
5.心臟性猝死：快速房顫時，心室率加快，有效心輸出量減少，冠狀動脈灌注量減少，可導致心臟驟停，房顫導致心臟猝死的主要原因有：房顫伴有預激綜合徵;肺動脈栓塞;急性心功能不全;神經，精神因素等。
