藍耳病感染後由於繼發感染的影響，會表現許多不同的臨床症狀。共同症狀是發熱，體溫達40.0~41.5度，體表皮膚髮紺、出血，皮膚嚴重發紺時呈藍紫色，耳部發紺呈藍紫色的頻度最大，因此，又把豬繁殖與呼吸障礙綜合症成為“藍耳病”。體表皮膚髮紺、出血是繁殖與呼吸障礙綜合症病程發展的一個重要症狀階段。一般表現五種情況。
毛囊出血
毛囊出血又常見兩種情況：一種是出血點密佈全身，針尖大，不會擴大，若病情好轉，出血點會逐漸消失。另一種是患豬皮膚、特別是頸部和背部皮膚密佈鐵鏽色或藍紫色出血點。
保育-生長豬 發病常突然出現厭食，體溫升高達40.0～41.5度，出現眼眶浮腫，發紺呈藍紫色，吻突發紺呈藍紫色，耳發紺呈藍紫色的三藍現象。
哺乳仔豬發病往往是經胎盤感染後生下的弱仔。這種弱仔多在產後24小時死亡，不死的3~4天后就出現毛焦、消瘦、鼻唇乾燥、呼吸困難、體溫升高、發抖、四肢做游泳狀姿勢、蹄邊發紺呈藍紫色、站立不起、拉稀、無力吸乳，死亡率高。
陰囊出血是公豬最常見的症狀。陰囊皮膚剛開始出血時是密密麻麻的淡血點，遠看似淡血斑，隨之越來越明顯，越來越嚴重，變為藍紫色，再進一步發展藍紫色出血灶壞死、幹固、硬結，類似藍紫色球形結痂。
