透骨草是多年生草本植物,高(10-)30-80 (-100)釐米。莖直立,4稜形,不分枝或於上部有帶花序的分枝,分枝叉開,綠色或淡紫色,遍佈倒生短柔毛或於莖上部有開展的短柔毛,少數近無毛。葉對生;葉片卵狀長圓形、卵狀披針形、卵狀橢圓形至卵狀三角形或寬卵形,草質,長(1-)3-11(-16)釐米,寬(1-)2-8釐米,先端漸尖、尾狀急尖或急尖,稀近圓形,基部楔形、圓形或截形,中、下部葉基部常下延,邊緣有 (3-)5至多數鈍鋸齒、圓齒或圓齒狀牙齒,兩面散生但沿脈被較密的短柔毛;側脈每側4-6條;葉柄長0.5-4釐米,被短柔毛,有時上部葉柄極短或無柄。[2] 穗狀花序生莖頂及側枝頂端,被微柔毛或短柔毛;
花序梗長3-20釐米;花序軸纖細,長(5-)10-30釐米;苞片鑽形至線形,長1-2.5毫米;小苞片2,生於花梗基部,與苞片同形但較小,長0.5-2毫米。花通常多數,疏離,出自苞腋,在序軸上對生或於下部互生,具短梗,於蕾期直立,開放時斜展至平展,花後反折。花萼筒狀,有5縱稜,外面常有微柔毛,內面無毛,萼齒直立;花期萼筒長2.5-3.2毫米;上方萼齒3,鑽形,長1.2-2.3毫米,先端多少鉤狀,下方萼齒2,三角形,長約0.3毫米。[2]